Разработка программ эпидемиологических исследований по распространенности инфекций, передаваемых половым путём

с созданием систем прогнозирования распространения и возникновения резистентности возбудителей инфекций, передаваемых половым путём, к применяемым антимикробным препаратам

В процессе работы по оценке клонального родства штаммов, циркулирующих на территории Российской Федерации проведены исследовния по разработке стандартизованного Протокола молекулярного типирования N.gonorrhoeae, в том числе:

  • усовершенствован метод выделения ДНК из культуры гонококков, позволяющий повысить выход ДНК N. gonorrhoeae за счет механического разрушения клеточных мембран всех клеток N. gonorrhoeae, помещенных в лизирующий буфер;
  • при разработке Протокола были использованы нуклеотидные последовательности праймеров для идентификации генов por и tbp N.gonorrhoeae, опубликованные на сайте веб-сайте www.ng-mast.net;
  • изменены профиль амплификации и количество циклов амплификации для генов por и tbp, что позволило повысить выход продуктов реакции амплификации и устранить регистрацию неспецифических продуктов реакции;
  • разработан Протокол молекулярного типирования N.gonorrhoeae путем одновременного определения нуклеотидных последовательностей гена поринового канала - por и tbp- гена, кодирующего бета-субъединицу трансферрин-связывающего белка - метод NG-MAST, позволяющий получить сиквенс-тип - индивидуальную генетическую характеристику изучаемых штаммов.

В результате проведенных исследований не установлено корреляций между сиквенс-типом N. gonorrhoeae и специфическими профилями антибиотикорезистентности. Однако у отдельных штаммов N. gonorrhoeae (сиквенс-типы: 438, 307, 2699, 2720, 2592, 387, 1152, 2697 и 8 новых сиквенс-типов) была отмечена ассоциация с мультирезистентностью к четырем и более антибиотикам.

В процессе выполнения работ по оценке клональной структуры и степени генетического разнообразия C. trachomatis, циркулирующих на территории Российской Федерации, проведены исследования по разработке Протокола молекулярного типирования C. trachomatis, выделяемой непосредственно из образцов клинического материала больных урогенитальной хламидийной инфекцией.

Для осуществления прогнозирования распространения антибиотикорезистентных штаммов гонококка на территории Российской Федерации разработан проект программы по моделированию и прогнозированию распространения гонококковой инфекции и антибиотикорезистентности её возбудителя на территории РФ.